Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms