Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms