Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms