Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM8

MGAT4C, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase C, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4CQ9UBM8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MGAT4CQ9UBM8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms