Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms