Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR4

VSX1, Visual system homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1Q9NZR4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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VSX1Q9NZR4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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