Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms