Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms