Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms