Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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LTBP3Q9NS15 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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LTBP3Q9NS15 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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LTBP3Q9NS15 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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LTBP3Q9NS15 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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LTBP3Q9NS15 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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LTBP3Q9NS15 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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LTBP3Q9NS15 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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LTBP3Q9NS15 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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