Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms