Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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