Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms