Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms