Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms