Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms