Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms