Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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GTF3C6Q969F1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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GTF3C6Q969F1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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GTF3C6Q969F1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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GTF3C6Q969F1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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GTF3C6Q969F1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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GTF3C6Q969F1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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GTF3C6Q969F1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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GTF3C6Q969F1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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GTF3C6Q969F1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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