Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms