Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU58

FAM222B, Protein FAM222B, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM222BQ8WU58 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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FAM222BQ8WU58 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM222BQ8WU58 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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