Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms