Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms