Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms