Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD1Q5VV17 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms