Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms