Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RNF212Q495C1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms