Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms