Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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