Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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