Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms