Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TLR1Q15399 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TLR1Q15399 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLR1Q15399 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLR1Q15399 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLR1Q15399 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLR1Q15399 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLR1Q15399 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLR1Q15399 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TLR1Q15399 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLR1Q15399 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TLR1Q15399 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLR1Q15399 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLR1Q15399 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms