Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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BRD3Q15059 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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BRD3Q15059 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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BRD3Q15059 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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BRD3Q15059 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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BRD3Q15059 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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BRD3Q15059 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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BRD3Q15059 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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BRD3Q15059 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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