Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms