Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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