Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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