Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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PTGDRQ13258 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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PTGDRQ13258 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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