Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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