Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
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