Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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