Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STX4Q12846 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STX4Q12846 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STX4Q12846 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STX4Q12846 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STX4Q12846 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STX4Q12846 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STX4Q12846 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
STX4Q12846 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
STX4Q12846 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STX4Q12846 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STX4Q12846 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STX4Q12846 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STX4Q12846 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STX4Q12846 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STX4Q12846 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
STX4Q12846 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STX4Q12846 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
STX4Q12846 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
STX4Q12846 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
STX4Q12846 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
STX4Q12846 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STX4Q12846 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
STX4Q12846 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
STX4Q12846 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STX4Q12846 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
STX4Q12846 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
STX4Q12846 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
STX4Q12846 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STX4Q12846 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STX4Q12846 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STX4Q12846 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms