Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms