Protein–RNA interactions for Protein: P84085

ARF5, ADP-ribosylation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF5P84085 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF5P84085 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF5P84085 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF5P84085 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF5P84085 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF5P84085 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF5P84085 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF5P84085 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF5P84085 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF5P84085 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF5P84085 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF5P84085 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF5P84085 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF5P84085 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF5P84085 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF5P84085 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF5P84085 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF5P84085 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF5P84085 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF5P84085 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF5P84085 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms