Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VBP1P61758 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VBP1P61758 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VBP1P61758 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VBP1P61758 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VBP1P61758 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VBP1P61758 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VBP1P61758 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VBP1P61758 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VBP1P61758 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VBP1P61758 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VBP1P61758 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VBP1P61758 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VBP1P61758 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VBP1P61758 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VBP1P61758 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VBP1P61758 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VBP1P61758 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VBP1P61758 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VBP1P61758 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VBP1P61758 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VBP1P61758 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VBP1P61758 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VBP1P61758 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VBP1P61758 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VBP1P61758 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VBP1P61758 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VBP1P61758 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VBP1P61758 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms