Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MCCD1P59942 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms