Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
MANFP55145 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
MANFP55145 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MANFP55145 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MANFP55145 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MANFP55145 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MANFP55145 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MANFP55145 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MANFP55145 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MANFP55145 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MANFP55145 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MANFP55145 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MANFP55145 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MANFP55145 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MANFP55145 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MANFP55145 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MANFP55145 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MANFP55145 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MANFP55145 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MANFP55145 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MANFP55145 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MANFP55145 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MANFP55145 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MANFP55145 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MANFP55145 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MANFP55145 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MANFP55145 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MANFP55145 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MANFP55145 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MANFP55145 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MANFP55145 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MANFP55145 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MANFP55145 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MANFP55145 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MANFP55145 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MANFP55145 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MANFP55145 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MANFP55145 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MANFP55145 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MANFP55145 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MANFP55145 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MANFP55145 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MANFP55145 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MANFP55145 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MANFP55145 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MANFP55145 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MANFP55145 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MANFP55145 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MANFP55145 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MANFP55145 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MANFP55145 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MANFP55145 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MANFP55145 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MANFP55145 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MANFP55145 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MANFP55145 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms