Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NESP48681 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NESP48681 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
NESP48681 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NESP48681 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NESP48681 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NESP48681 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NESP48681 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NESP48681 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NESP48681 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NESP48681 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
NESP48681 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NESP48681 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NESP48681 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NESP48681 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NESP48681 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NESP48681 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NESP48681 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NESP48681 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
NESP48681 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NESP48681 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NESP48681 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NESP48681 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NESP48681 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NESP48681 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NESP48681 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NESP48681 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NESP48681 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
NESP48681 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NESP48681 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NESP48681 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NESP48681 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NESP48681 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NESP48681 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NESP48681 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NESP48681 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NESP48681 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NESP48681 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NESP48681 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NESP48681 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NESP48681 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NESP48681 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NESP48681 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NESP48681 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NESP48681 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NESP48681 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NESP48681 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NESP48681 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NESP48681 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NESP48681 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NESP48681 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NESP48681 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NESP48681 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NESP48681 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NESP48681 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NESP48681 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NESP48681 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NESP48681 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NESP48681 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NESP48681 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NESP48681 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NESP48681 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NESP48681 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NESP48681 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NESP48681 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NESP48681 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NESP48681 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NESP48681 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NESP48681 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NESP48681 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NESP48681 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NESP48681 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NESP48681 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NESP48681 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NESP48681 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NESP48681 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NESP48681 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NESP48681 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NESP48681 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NESP48681 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NESP48681 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NESP48681 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NESP48681 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NESP48681 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NESP48681 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NESP48681 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NESP48681 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NESP48681 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NESP48681 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
NESP48681 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NESP48681 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NESP48681 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NESP48681 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NESP48681 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NESP48681 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NESP48681 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NESP48681 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NESP48681 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NESP48681 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
NESP48681 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms