Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER4P35408 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms