Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms