Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms