Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4AP27815 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms